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另一种blast2go的思路

blast2GO是用序列相似性得到go的信息,而网上很多软件要么针对某个蛋白的,要么就是只能网上运行的,还有就是只有windows的,烦- - 但如果用名字对应会怎么样,尝试了一番记录如下: 我们的序列先进行blast Nr库得到的是比对的蛋白序列,名字有gi号和refseq号; NCBI FTP里面有个gene2go的文件,发现是geneid对应go号; 又从FTP里面发现了gene2refseq文件,是geneid对应gi号; 好了,由此我们可以把这三者进行了串联,结果发现了350多条对应关系,而blast2go的结果有303,\(^o^)/~! 但是我将两者取了交集之后,发现只有5个!只有5个!只有5个!!!瞬间伐开心。。。 所以我在想是不是有几种情况要考虑: 首先是过滤,我们blas...阅读全文

博文 2016-01-16 12:00:01 skenoy

beego orm 多个字段过滤的问题

原因是这样子的: 现在有两个字段,年份(year),和学期(term) beego的orm现在支持单独一个字段的过滤,例如2013年~2015年: ``` tmp := map[string]interface{} o := orm.NewOrm() qs := o.QueryTable("table").Filter("year__gte", 2013).Filter("year__lte", 2015).All(&tmp) ``` 如上可以得到年份的区间。 可是我的需求是多个字段过滤,例如2013年2学期~2015年1学期 用sql语句可以表示为: ``` var sql string = "select * from table where yea...阅读全文

golang中的http.FileServer通常要跟http.StripPrefix结合使用

用go写一个文件服务器很简单: http.handle(“/”, http.FileServer(http.Dir(“doc”)) http.ListenAndServe(":8888”, nil) 打来localhost:8888,就能看到doc目录下的所有文件。 但如果,你想用localhost:8888/doc来显示进入文件目录,则需要 http.Handle(“/doc", http.StripPrefix(“/doc", http.FileServer(http.Dir(“doc")))) http.StripPrefix用于过滤request,参数里的handler的request过滤掉特定的前序,只有这样,才能正确显示文件目录...阅读全文

博文 2015-06-17 20:18:48 u011649436

Go语言的素数筛

package main import ( "fmt" "runtime" "runtime/debug" ) // 返回生成自然数序列的管道: 2, 3, 4, ... func GenerateNatural() chan int { ch := make(chan int) go func() { for i := 2; ; i++ { ch <- i } }() return ch } // 管道过滤器: 删除能被素数整除的数 func PrimeFilter(in <-chan int, prime int) chan int { out := make(chan int) go func() { for { if i := <-in; i%prime != 0 { out <- ...阅读全文

博文 2014-10-10 07:00:02 chai2010

Golang基于DFA算法实现敏感词汇过滤

DFA:确定有穷自动机。 具体功能: 将敏感词汇保存在map中。 对敏感词汇进行过滤,将敏感词变为“*”。 对无意义符号进行忽略处理。 敏感词数据结构: { 王:{ isEnd: false 八:{ isEnd:false 蛋:{ isEnd:true } } } } 无意义符号数据结构: { "@":Null (空结构体) } package main import ( "fmt" "strings" ) type Null struct {} var sensitiveWord = make(map[string]interface{}) var Set = make(map[string]Null) const InvalidWords = " ,~,!,@,#,$,%,^,&,*,(...阅读全文

博文 2019-06-03 13:34:39 贝塔船长

golang 过滤非中文字符

package main import ( "fmt" "regexp" ) var hzRegexp = regexp.MustCompile("^[\u4e00-\u9fa5]$") func main() { str := "问11" StrFilterNonChinese(&str) fmt.Println(str) } func StrFilterNonChinese(src *string) { strn := "" for _, c := range *src { if hzRegexp.MatchString(string(c)) { strn += string(c) } } *src = strn ...阅读全文

博文 2018-06-23 18:34:39 不浪人

Go语言学习——如何实现一个过滤器

1、过滤器使用场景 做业务的时候我们经常要使用过滤器或者拦截器(听这口音就是从Java过来的)。常见的场景如一个HTTP请求,需要经过鉴权过滤器、白名单校验过滤、参数验证过滤器等重重关卡最终拿到数据。 Java使用过滤器很简单。XML时代,只要添加一个过滤器配置再新建一个实现了Filter接口的xxxFilter实现类;Java Configuration时代,只要在xxxConfiguration配置类中声明一个Filter注解,如果想设置Filter的执行顺序,加上Order注解就行了。 Java的过滤器实在太方便也太好用了。 以至于在Java有关过滤器的面试题中,只有类似于“过滤器的使用场景有哪些?”,“过滤器和拦截器有什么区别?“,几乎很少听到”你知道过滤器是怎么实现的吗?“,”如果...阅读全文

博文 2019-08-31 15:09:57 bigdataZJ

golang实现原始数据库过滤语法

golang gin 数据库过滤语法 func (s APIGetAlarmListsInputs) collectFilters() string { tmp := []string{} if s.StartTime != 0 { tmp = append(tmp, fmt.Sprintf("timestamp >= FROM_UNIXTIME(%v)", s.StartTime)) } if s.EndTime != 0 { tmp = append(tmp, fmt.Sprintf("timestamp <= FROM_UNIXTIME(%v)", s.EndTime)) } if s.Priority != -1 { tmp = append(tmp, fmt.Sprintf("pr...阅读全文

博文 2018-09-27 15:34:51 斯嘎啦