go 新手:用 bufio的scan按行读取 约2.5G的fasta文件,发现读取得很慢,慢得不敢想象

0106WeiWeiDeng · 2019-01-14 14:34:46 · 3256 次点击

用biogo里面的fasta 和 seqio, 速度会快很多, 但是仍然赶不上python中的pyfaidx, 没人去开发go的库啊,我准备自己写个类似于pyfaidx的go库。

#19
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我不知道是bufio的scan慢,还是字符串string的+=操作慢,或者是其他原因

#1

请大神给一些优化的建议

#2